En la tercera temporada, el Campamento Jaha es renombrado a «Arkadia». Se mantienen en paz con los terrestres durante unos meses, pero sufre un cambio cuando Pike, un antiguo maestro es elegido canciller y empieza una guerra con los terrestres. Se releva que una inteligencia artificial llamada A.L.I.E. fue la responsable de lanzar los misiles que destruyeron a la Tierra. La inteligencia artificial sigue activa y toma el control mental de la mayoría de las personas de Arkadia y de Polis, la capital de los terrestres. Al final de la temporada, Clarke logra destruir a A.L.I.E.